治療脂肪肝的原則是根除病因、科學膳食、堅持體育鍛煉、施以中西藥等綜合措施。
１．病因治療：
營養過剩性脂肪肝：最為常見。主要方法是控制熱量攝入，保證生理需要，飲食上不貪多，不求精；改變飲食結構，要低脂少糖；堅持健身，維持標準體重。
肥胖性脂肪肝：也較常見。與營養過剩密切相關。主要措施是節食減重，但不要操之過急，每年減重１０－２０公斤為宜。生活上合理搭配三大營養素，持之以恒，健身鍛煉。
糖尿病性脂肪肝：重點是糾正糖代謝紊亂。在抗糖尿病治療中堅持目標治療。糖化血紅蛋白＜６．５ｍｍｏｌ／Ｌ；血壓控制１３０／８０ｍｍＨｇ左右。
肝炎后脂肪肝：許多肝炎病人在治療中往往陷入誤區，即休息、高蛋白、高糖、高熱量的“保肝”措施。正確的應是祛毒護肝，移除脂肪。給予足量的蛋白質、低脂肪、高維生素，適當體育鍛煉，促進肝細胞恢復。
２．膳食治療：
食療的意義是維持標準體重，攝入適當熱量，營養素比例合理，糾正不良飲食嗜好，防治并發癥的發生。
１９９７年中國營養學會在《中國居民膳食指南》中指出①食物多樣化，以谷類為主；②多吃蔬菜水果；③多用奶類及豆制品；④常吃魚、蛋及瘦肉，少吃肥肉及葷油；⑤食量與體力活動消耗保持平衡；⑥清淡少鹽；⑦戒煙限酒。
《指南》中的意見具有普遍指導意義。
３、體育鍛煉：
堅持體育鍛煉可以達到增強體質、提高整體性生理效應，增強人體抵抗力和免疫力，精神煥發，體力充沛，改善生活質量，延年益壽，是人所共知的常識。同時鍛煉對脂肪肝還有治療意義，如消耗過剩的能量，降低甘油三酯及血糖；減少脂肪肝出現的倦怠、乏力、氣悶等癥狀，延緩心血管的并發癥。總之運動消耗過多熱能比減少攝入熱能更好更重要。
運動的方式、強度、頻率應根據患者的文化程度、病情狀況、場地條件、個人愛好、習慣、興趣，選擇適合自己的運動項目、時間、運動量。其原則是參加低強度的全身運動，如慢跑、騎自行車、上下樓、打羽毛球、跳舞、做廣播操、游泳、練氣功、打太極拳等。
參加體育鍛煉的要求應是貴在堅持、循序漸進、運動量由小到大，運動時間由短到長，運動技巧由簡到繁。最好是群體鍛煉、趣味活動，這樣可以彼此交流心得，提高活動質量。
４、藥物治療：
脂肪肝是多種因素導致肝臟脂肪代謝紊亂致使脂肪堆集在肝細胞的結果。市場上治療脂肪肝的中西藥物繁多，但必須明確目前尚無一種公認的特效藥物。不要聽信夸大療效的廣告商業宣傳，但也不要失去信心放棄治療。
下面一些藥物要權衡利弊，輪換使用，對于脂肪肝在阻斷病因、護肝移脂、終止發展、促進逆轉等方面有所幫助。常用的藥物如下：肝得健、益肝靈、肝泰樂、氨基酸、氟磷脂、維生素Ｃ、維生素Ｅ、前列腺Ｅ、吉非羅齊、辛伐他汀、阿托伐他汀、血脂康、脂必妥等。